MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-9 DNA

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020825	AAG	2	6	641	646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279721
2	NC_020825	CTC	2	6	807	812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279722
3	NC_020825	TCA	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279722
4	NC_020825	AAT	2	6	974	979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279722
5	NC_020825	TCT	2	6	1000	1005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279722
6	NC_020825	CTT	2	6	1016	1021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279722
7	NC_020825	TCA	2	6	1054	1059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279722
8	NC_020825	T	8	8	1177	1184	0 %	100 %	0 %	0 %	472279722
9	NC_020825	GAA	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279723
10	NC_020825	A	6	6	1346	1351	100 %	0 %	0 %	0 %	472279723
11	NC_020825	AAT	2	6	1490	1495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279723
12	NC_020825	TTGTTC	2	12	1630	1641	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	472279723
13	NC_020825	CTA	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279723
14	NC_020825	TTG	2	6	1726	1731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279723
15	NC_020825	TTCAC	2	10	1766	1775	20 %	40 %	0 %	40 %	472279723
16	NC_020825	GTA	2	6	1791	1796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279723
17	NC_020825	TCG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
18	NC_020825	TTC	2	6	1902	1907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279724
19	NC_020825	GTTT	2	8	1912	1919	0 %	75 %	25 %	0 %	472279724
20	NC_020825	TTG	2	6	1923	1928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279724
21	NC_020825	CGT	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
22	NC_020825	GCT	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
23	NC_020825	CAAC	2	8	2090	2097	50 %	0 %	0 %	50 %	472279724
24	NC_020825	GCT	2	6	2098	2103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
25	NC_020825	GTT	2	6	2129	2134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279724
26	NC_020825	TAA	2	6	2157	2162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279724
27	NC_020825	GAT	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279724
28	NC_020825	TATT	2	8	2314	2321	25 %	75 %	0 %	0 %	472279724
29	NC_020825	ATT	2	6	2367	2372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279724
30	NC_020825	CA	3	6	2603	2608	50 %	0 %	0 %	50 %	472279724
31	NC_020825	CTG	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279724
32	NC_020825	ACTTCA	2	12	2692	2703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279724
33	NC_020825	CTT	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279724
34	NC_020825	CCGA	2	8	2879	2886	25 %	0 %	25 %	50 %	472279724
35	NC_020825	ATT	2	6	2929	2934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279724
36	NC_020825	TGA	2	6	2979	2984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279724
37	NC_020825	ATTTG	2	10	2988	2997	20 %	60 %	20 %	0 %	472279724
38	NC_020825	GCC	2	6	3515	3520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279725
39	NC_020825	ACG	2	6	3630	3635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279725
40	NC_020825	CAAGC	2	10	3671	3680	40 %	0 %	20 %	40 %	472279725
41	NC_020825	ACC	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279725
42	NC_020825	A	7	7	3720	3726	100 %	0 %	0 %	0 %	472279725
43	NC_020825	TTA	2	6	3776	3781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279725
44	NC_020825	CAAC	2	8	3795	3802	50 %	0 %	0 %	50 %	472279725
45	NC_020825	A	7	7	3825	3831	100 %	0 %	0 %	0 %	472279725
46	NC_020825	GAC	2	6	3894	3899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279725
47	NC_020825	TCAA	2	8	4951	4958	50 %	25 %	0 %	25 %	472279726
48	NC_020825	AAG	2	6	5100	5105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279726
49	NC_020825	AAT	2	6	5150	5155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279726
50	NC_020825	CCAT	2	8	5254	5261	25 %	25 %	0 %	50 %	472279726
51	NC_020825	GTA	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279726
52	NC_020825	ATAC	2	8	5292	5299	50 %	25 %	0 %	25 %	472279726
53	NC_020825	CAC	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279726
54	NC_020825	TAAC	2	8	5330	5337	50 %	25 %	0 %	25 %	472279726
55	NC_020825	ATCT	2	8	5385	5392	25 %	50 %	0 %	25 %	472279726
56	NC_020825	TCC	2	6	5405	5410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279726
57	NC_020825	A	6	6	5436	5441	100 %	0 %	0 %	0 %	472279726
58	NC_020825	TAA	2	6	5521	5526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279726
59	NC_020825	CCT	2	6	5541	5546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279726
60	NC_020825	C	6	6	5603	5608	0 %	0 %	0 %	100 %	472279726

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.